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Exemplificando o problema para ficar mais claro:

1. Rodo o arquivo sample_tray.mso.
2. Modifico o arquivo tray.mso inserindo unidade (m0.5/s) à constante 1.84 da equação da vazão de líquido do prato (para a retirada do warning).
3. Rodo novamente o flowsheet do exemplo e o programa fecha (Segmentation fault)

Acredito que haja algum problema quando é realizada a expansão do sistema de equações. Segundo as informações do console, o EMSO realiza a redução de índice e pára na associação das variáveis.

A medida de tempo de simulação do problema está retornando sempre zero.

Exemplo:

Simulation of 'BB_react' finished successfully in 0 seconds.

Na janela de reportagem do EMSO, os indices da Jacobiana comecam de zero, como na linguagem C, e no EML as variaveis comecam de 1, como na linguagem FORTRAN. Isto pode provocar um erro de interpretacao. Seria interessante que ambos comecassem de 1, como eh mais natural.